Le projet s'articule entre différentes tâches de travail.

• La tâche 1 est la tâche de coordination des missions entre tous les partenaires. Elle est réalisée à l'Institut Pasteur de Lille (par Eduardo Dei-Cas et Cécile-Marie Aliouat, équipe BDPEE).
• La tâche 2 est dédiée à la collecte et à la dissection des poissons en mer, à terre auprès des mareyeurs ou en eau douce (lacs Léman, du Bourget ou d'Annecy)
• La tâche 3 vise à détecter les parasites (Anisakidés, Diphyllobothridés, Cryptosporidium), les identifier par des techniques de biologie moléculaire, renseigner la base de données PARAFISH et analyser statistiquement ces données.
• La tâche 4 a pour but de développer un système de vision intelligente permettant de détecter plus systématiquement les larves d'Aniskidés dans les filets de poisson.
• La tâche 5 vise à diffuser le savoir accumulé au cours de cette action Fish-Parasites vers les professionnels de la filière mais aussi vers le grand public afin que ceux-ci connaissent mieux le risque lié aux parasites de poisson. Pour ce faire, ont été mis en place: une plateforme d'identification des parasites de poisson à l'ANSES de Boulogne s/mer ouverte aux professionnels, le présent site internet accessible par le grand public et des sessions de formation continue ouvertes aux professionnels de la filière pêche.